台北市長柯文哲昨（5日）宣布市民施打疫苗免費，政院昨晚發聲明表示已編列40億預算，行政院長蘇貞昌今更強調，本次編列特別預算時有匡列相關預算，民眾依照指揮中心順序打疫苗的話，不但疫苗不用錢，連掛號費、行政費用都由中央編列預算支應。柯文哲今（６）日下午表示，中央編列預算並沒公文給北市，北市當然不曉得有此政策，並酸中央「昨天到今天變來變去」，北市不管是現在公費或以後自費打疫苗，都通通免費。

台北市政府下午召開疫情相關記者會，柯文哲致詞表示，目前台北市的策略以最低成本達到三級管制效果，這大概也是目前對付疫情的最佳戰略，但是仍然對市府有些壓力，雖然疫情有壓制住，不過只要一放鬆，隨時會再擴大，還是需要民眾合作。

柯文哲提到，自己看新聞發現端午節車票聽說賣光，上波母親節人流造成這波疫情，才好不容易壓制住，希望下週端午節，大家盡量留在家裡，「也不是叫你躲在山洞裡面」，還是可以保持聯絡、採用視訊。

柯文哲指出，先前曾到第一線看打疫苗情況，過去打流感疫苗時，去醫學中心、區域醫院、地區醫院，甚至診所，掛號費都不一樣，甚至到聯醫門診部掛號50元，到里長那打卻不用錢，這很奇怪。

因此，柯文哲說，設計整個打疫苗系統要更方便，並不要讓金錢變成一個因素，讓市民跑到不用錢的地方打疫苗，也為鼓勵市民提高接種率，另外既然要打疫苗，不需要再掛號一次，為了行政效率提高，將掛號、問診合併，不用再收掛號費，減少民眾醫院負擔，用人頭費是最簡單的方式，目前北市打算打每一劑補貼100元，北市算過若疫苗涵蓋率達50％，大概要準備2.23億；涵蓋率達75%，則約要3.34億。

柯文哲表示，中央宣布全國打疫苗不用錢，北市也樂觀其成，本來北市就有這計畫，盼加快行政效率。

會後，對於有媒體提問，中央表示早編列預算讓全國施打疫苗免費，有側翼批柯文哲「收割」，北市是用中央預算嗎？柯文哲回應，中央編列預算沒公文給北市，北市當然不曉得，預算編列是一回事，其實政治核心是執行力。

柯文哲直言，老實講，他看中央昨天到今天變來變去，在台北市不管現在公費或以後自費，通通免費，他也覺得不應當身份別不一樣，有時現在打不要錢，以後打要錢，又因為身份別區分，很奇怪。

柯文哲強調，北市本來策略是，只要是台北市民，都是市府照顧對象，不管現在、未來，現在開始就是不收費。

柯文哲說，有這政策是因為到第一線視察打疫苗狀況，發現這樣用人頭費付給施打疫苗的單位，可以簡化很多行政程序，加速流程，也減少市民負擔。他倒覺得這樣把事情做好就好，「到這時候，還要搶功幹什麼……我就覺得很奇怪」。