衛福部桃園醫院爆發武漢肺炎本土群聚感染引起全台關注，被外界點名是2003年SARS期間「和平封院」決策者之一的前台北市衛生局長邱淑媞跳出來批評批指揮中心「欠缺防疫邏輯」，不過許多網友卻翻出過去她的防疫決策，湧入她臉書留言怒嗆：「怎麼不敢承認當初害死多少人」、「用錯誤決策殺人」。而她竟回應說當年SARS是民進黨「放的病毒」害死和平醫護，並反咬並「中央甩鍋地方」，再度引發輿論抨擊。邱淑媞27日凌晨又在臉書Po文為自己辯護，還原當年「封院到底是誰決定的？中央與地方，看法有不同嗎？」
邱淑媞表示，SARS是一個全新的病毒，致死率高達30%，是新冠肺炎的30倍。 2003年4月，在「三零」的完美防疫成績下，症狀不典型（腹瀉）的病人，爆發了台灣第一個超級傳播事件，於4月21日起短短三天，找出十多位疑似病例，分布於A、B棟不同樓層及部門。中央與地方之代表於4月22共同研判疫情，決定包括暫停、急診門診減半等若干措施。4月23日，於中央防疫會報請求當時擔任召集人的前副總統陳建仁支持，成立了中央與地方聯合處理小組，並自即日起每天開會共商防疫措施。
邱淑媞回憶說，當時中央與地方都深覺沒有第二個選擇，必須在最短時間阻斷傳播，否則傷亡恐難以估計。4月24日一早，北市府因為考量員工需要時間安排孩子接送等情況，因此晨會決議要在傍晚進行封院；她說：「而開完晨會，回到辦公室，同仁即慌張地告訴我，接獲中央傳真的衛生署署長涂醒哲公文，要求『立即』管制人員進出，我們都傻眼了，這種事，需要時間準備，怎麼立即呢？就在此時，市府接到行政院林信義副院長的邀請，由歐副市長和我去行政院開會；而衛生署是由涂醒哲與疾管局局長陳再晉代表。」
邱淑媞提到，會中決定了五大措施，包括「中央及地方全力合作，防止疫情擴散」、「和平醫院暫時關閉、全面管制」、「所有病人集中治療，員工全數召回集中隔離，院內人員家屬居家隔離，對過去兩週進出醫院人員及病患進行追蹤，遇有症狀立即治療」、「對集中隔離所需處所，請台北市評估地點，由中央全力協助」、「因情況特殊，很多事情需第一時間進行處理，包括醫療資源和行政協助，中央政府各部會要做好協調，並全力、主動、積極協助各級政府做好防疫措施。」並於下午一點拉起封鎖線，執行了俗稱的「封院」。
邱淑媞續指：「在4月24日封院後，病患與員工驚恐萬分，我特別在『中央與地方聯合處理小組』會議上，拜託一些專家進駐和平醫院，也拜託了張上淳教授進入向員工廣播指導，但張教授臨時決定不進去；何美鄉、美國CDC專家、疾管局人員次日有進去進行疫調、指導。而台北市政府，則派了璩大成、副局長許君強、科長張朝卿、防疫技士魏惠志進駐院內；27日，由葉金川教授進入，發揮他的領導統御經驗，稍稍安定了人心。並在與葉教授討論員工狀況後，尋求中央協助調度資源，展開撤離清空，至5月8日，完成全面淨空。」
邱淑媞強調，由於封院是沒有人有過的經驗，尤其是這麼大的一個醫院，相關的配套極其複雜，也需要非常多時間，但防疫需要與病毒賽跑，恐怕也不能拖延。監察院、市議會和部分醫師罵說「倉促封院、缺乏配套」，而前疾管局局長蘇益仁卻罵說「封得太慢」，讓邱淑媞直說「有人有標準答案嗎？」因此她在臉書「還原歷史」，並警告說，相關事蹟都有保留證據，對於繼續惡意說謊詆毀者，將進行蒐證，保留法律追訴權。
