針對有媒體指稱「封和平醫院的元兇是馬英九」，前總統馬英九辦公室今（25）天發布新聞稿指出，當年的防疫決策模式跟現在一樣，都是由「中央下令，地方執行」，並還原當年封院的決策是由行政院邀集衛生署及北市府召開緊急會議，會中達成暫時關閉和平醫院的共識，並共同對外宣布，亦即中央和地方一致的決定。
馬辦指出，每當外界討論過去的防疫經驗時，就屢屢有人拿「和平封院」轉移焦點，事實是，當年的防疫決策模式跟現在一樣，都是由「中央下令，地方執行」。如今防疫當頭，呼籲各界尊重專業，配合中央流行疫情指揮中心齊心防疫，勿再以此噴政治口水、以訛傳訛，誤導大眾的防疫認知。
馬辦還原當年SARS疫情發生導致和平醫院封院的情況，2003年4月間，和平醫院爆發院內感染，情況危急，台北市政府於4月24日晨間會議時，討論到將對和平醫院採取管制措施。會議結束後，北市府即收到時任行政院衛生署長涂醒哲發來的最速件公文，要求北市衛生局立即成立接管小組進駐和平醫院，全面管制人員進出。24日上午，行政院並邀集衛生署及北市府召開緊急會議，會中達成暫時關閉和平醫院的共識，並由時任行政院副院長林信義、涂醒哲、時任台北市副市長歐晉德在行政院召開記者會，共同宣布台北市和平醫院封院。
馬辦表示，「中央下令，地方執行」，就是當時的決策過程。如同現在由中央流行疫情指揮中心負責武漢肺炎的防疫決策，SARS發生時，中央也在衛生署成立疫情因應小組，和平封院這種重大決策，並非地方政府就可以單獨決定。
馬辦指出，和平封院後，確實有效控制疫情外散，行政院、北市府及防疫專家們，也都盡最大的努力降低院內損害。和平封院雖然達到管制疫情的效果，但不可否認的，對相關當事人也造成心理創傷。防疫很少有完美對策，總是在困難當中取捨，如同此次部立桃園醫院的防疫管制措施，也是不斷調整，以求盡善。
馬辦強調，SARS的經驗與教訓，為台灣的感染防治帶來很大的進步；有了和平封院的經驗，之後的全面或局部封院，也都能有更周全的配套，減少恐慌狀況。過往的防疫經驗當然可以檢討，但必須基於事實，才能有助改正缺失。18年前的SARS讓台灣付出重大代價，也換得珍貴經驗，這些經驗都應化做現今防疫的助力，而不是無謂的政治口水，更不能成為少數無良政客藉機政治操作的血饅頭。
