陳時中今年曾對外表示，確診者治療費用平均每人210萬元，讓外界質疑，若境外移入確診者的醫療費用也比照辦理，醫療成本是否過高？對此指揮中心發言人莊人祥表示，移工大多是自集中檢疫後採檢確診，相關醫療成本每人約80萬元皆國家支付，引發外界熱議。

因國際疫情持續延燒，境外移入案例已成常態，尤其印尼疫情不斷升溫，導致印尼移工確診病例持續增多，今年至目前為止印尼境外移入病例已經有107例，而光是上周一至今日共累計了49名，指揮中心雖昨天宣布自12月4日起，印尼籍移工暫停來台工作二週，目前也共14家印尼國外人力仲介公司訓練中心被暫緩仲介，但因因武漢肺炎為第五類法定傳染病，確診後這些移工的相關隔離醫療費用，不分本國、外國籍皆由政府支付。

今年陳時中曾指出，武漢肺炎本土個案治療費用平均每人210萬元，若境外移入確診者的醫療費用也比照辦理，醫療成本實在嚇人！對此莊人祥指出，當時指揮官是以本土個案來推估，因此需將相關接觸者的追蹤、疫調等相關費用納入考量；至於印尼移工的部份，因移工入境後皆集中檢疫、期滿後才進行採檢，少了疫調、與追蹤成本，加上多數移工年輕，身體狀況較佳，住院天數不長，推估每人約80萬左右。

武漢肺炎是傳染性疾病，被列為第五類法定傳染病，莊人祥強調若患者未治療好反而會引發其他傳染，讓境外移入病患妥善接受隔離治療，最大目的是保護國人社區的安全，避免疫情擴散。