武漢肺炎疫情持續擴大，為確保國軍部隊戰力不受影響，國防部長嚴德發29日下令，要求在春節期間曾與中國籍家屬及赴中工作家屬有密切互動的官兵，需主動回報及在家隔離14天，讓國軍營區免受疫情波及。

國防部發言人史舜文表示，隨著國軍大部隊29日起陸續收假，嚴德發上午召集參謀總長黃曙光與三軍司令等下達防疫指示。現三軍各營區營門已開始量測體溫，並且監管已入營區官兵的健康狀況，發燒者立即就醫，並指示軍醫局必須作好疫情掌握，冀能阻止武漢肺炎疫情蔓延至營區。

史舜文指出， 國防部要求各部隊必須掌握過年期間與赴中工作或中國籍家屬有密切互動的官兵，有關人士除了主動回報外，暫勿須回營收假，要立即在家自主隔離14天，。

另外，國防部要求三軍部隊對官兵進行衛教與防疫常識宣導，盡量避免在密閉空間的活動，若須進入密閉空間，則須全員戴上口罩。