教宗方濟各28日宣佈，將《梵蒂岡秘密檔案》更名為《梵蒂岡使徒檔案》，希望藉此消除有關保密性的任何負面含義。
梵蒂岡典藏大量檔案，尤其是歷代教宗的重要資料。存放這些檔案的書架排起來長達85公里，有些存放在地下掩體中。自1881年以來，學者可以申請使用其中大部分的檔案，但有些檔案並不開放。
教宗指出，「秘密」(secret)這個詞彙一開始就具有誤導性，起因於對拉丁文原文的誤解。這個檔案的拉丁文的原始名稱是“ archivum secretum”，而“ secretum”可以表示隱藏、私有、秘密、遠程或單獨。當時使用致這個拉丁文名稱是要表達一個確切的含義，即這些檔案並不適合開放給所有人閱覽。
教廷的這些檔案引起爭議的部分在於，目前為止，學者只能調閱1939年2月以前的檔案。其後爆發第二次世界大戰，當時在任的教宗庇護十二世與希特勒政權之間究竟有無某種默契，一直是學界想追究的議題。當時納粹德國和義大利法西斯政權都曾大肆迫害人權，甚至殺害天主教神職人員，但教廷卻保持中立，並未出面。庇護十二世也因此受到後世指謫。
1933年7月20，納粹政權與羅馬天主教廷簽定《德意志國與梵諦岡協定》，教廷同意將德國境內的政治團體和公會加以解散，以換取納粹政權對於教會的承諾：確保天主教教會在德國境內指派神職人員、掌握學校教育，與進行天主教活動的權利。代表教廷與納粹政權簽定《德梵協定》的教廷國務卿佩西里樞機主教(Cardinal Eugenio Pacelli)，於1939年繼任教皇，是為庇護十二世。
許多歷史學家認為，天主教會在庇護十二世的領導下，面對納粹政權各種暴行的反應，乏善可陳。納粹德國入侵波蘭後，殺害4位主教和二千多名神父修女，梵蒂岡也不置一詞。猶太社群更認為，當時的天主教會對於希特勒大屠殺，根本毫無作為，也沒有阻止。梵蒂岡則替庇護十二辯護，說他曾在幕後用外交手段，試圖拯救許多人的性命。
相信庇護十二世清白的教宗方濟各將讓各界於2020年3月2日起，調閱1939-1958年間的教宗檔案。
教宗方濟各說，他希望把《梵諦岡秘密檔案》更名為《梵蒂岡使徒檔案》能有助於洗刷庇護十二世的汙名。
