高雄市於五月底發生入夏以來首例登革熱，截至目前高雄市確診28例，高雄市韓國瑜在造勢活動中卻表示，疾管署對高雄登革熱漠不關心，對此，疾管署澄清，即使假日也未停止至社區協助防疫工作，更從北中南區調派人員前往高雄市協助高雄市登革熱防治，自5月29日至6月30日已支援651人次，並強調，絕無不幫高雄市登革熱防治的情形。
有媒體報導，韓國瑜在造勢活動致詞時指出，2018年印尼、越南爆發登革熱，政府派疾管署到印尼、越南，出錢出力又出經驗，而對高雄登革熱漠不關心。
對此，疾管署澄清，疾管署動員駐在高雄市之高屏區管中心人力，協助高雄市防疫人員進行孳生源檢查與疫情分析等防治工作，即使假日亦未停止至社區協助防疫工作，實驗室亦是如此。
此外，更從北中南區調派人員前往高雄市協助高雄市登革熱防治，自5月29日至6月30日，已支援651人次，另也請國家衛生研究院，調派其蚊媒防治研究中心人員，支援高雄市病媒蚊監測工作，掌握病媒蚊孳生分布狀況，以瞭解防治工作是否落實，其已支援高雄市305人次。絕未有不幫高雄市登革熱防治之情形。
疾管署指出，高雄市於6月14日傍晚送出公文向中央提出5,318萬登革熱防治經費，衛福部亦立即於週末加班協助審查與積極向行政院申請，行政院亦已於6月19日全數核定，並於6月24日函復高雄市政府，先行核撥2,660萬元，請其儘速用以辦理各項登革熱疫情控制工作。
疾管署表示，與其他國家進行防疫交流合作，向以平等、互惠、相互尊重、相互學習的精神與方式進行，在與越南進行之結核病防治合作，及與印尼進行之登革熱防治合作，亦不例外，該項合作計畫自106即開始進行，所運用經費亦低於用以補助支援高雄市之登革熱防治經費，自無未幫高雄登革熱防治，卻幫印尼、越南之情形。
