蘭嶼核廢貯存場約存有10萬桶低階核廢料，擬定搬遷回原產地，但遭到新北、屏東地方政府的反對導致時程延宕，105年原能會認定台電公司在蘭嶼核廢遷移計畫跳票，因此開罰新台幣1000萬元，對此，台電認為，當初建議候選場址早已公告，是因台東、金門政府不辦公投所致，法院認定本件開罰有違行政罰原則，盼台電公司免罰。

原能會主張，貯存在蘭嶼的低階核廢料長期未遷移，而台電公司也未能在105年3月底依規定提出最終處置場址，因此於同年7月底依法對台電開罰新台幣1000萬元。

對此，台電不滿，認為建議候選場址早已公布，經濟部也已函請台東、金門縣政府辦理公投，但兩地政府並未配合，所以不能將責任歸於台電，台電向台北高等行政法院提起行政訴訟，經法院後認定，台電並沒有地方政府監督權責，本件開罰有違行政罰法第1條明定之行政開罰原則，認為台電請求撤銷原處分有理，台電公司勝訴免罰。