行政院前院長賴清德、總統蔡英文相繼登記民進黨總統初選，引起黨內人士憂慮。民進黨立委鄭運鵬則提出不同看法，認為蔡英文超級抗壓、賴清德堅持理念，他們都有高度的民主素養及政治理想，對於台灣未來，他們二位缺一不可，也因此這是怎麼搭檔合作的問題，不是誰進誰退的問題。
鄭運鵬在臉書上說，蔡總統的辛苦，是背了三年來整個行政團隊的包袱，她處理這幾十年難題的年改、核能、同婚等等族繁不及備載的陳疴難題，絕對是受傷最重的人，換成各政黨或自居無黨的任何一位政治領袖，哪一位有自信扛得下來？從去年1124敗選之後，整個政府和執政黨幾乎是匍匐前進，一邊要回顧自己的缺失，一邊摸出該走的路，蔡英文總統，也絕對是壓力最大的人。
鄭運鵬指出，蔡英文的振作大家都看到，行政院的進擊讓大家叫好，中央黨部的積極讓大家放心，他強烈感受到，比賽現在才要開始，我們的團隊再擴大堅強，如何合作整合戰力，是當務之急，因此，他對於黨內總統初選有二位登記，雖然意外，但他完全正面看待，「回頭想想，在去年的重大挫敗之下，如果上週只有一位登記，感覺也是怪怪的」。
鄭運鵬表示，雖然很多朋友會憂慮、擔心分裂，但他身為民進黨立委、從大學時期就幫忙台北市和高雄市寫都市計畫，出社會後幫民進黨處理文宣選務，身為長期的政策幕僚，現在不幫民進黨現在的局勢思考如何前進，他自認愧對自己長期對台灣的理想，「再強調一次，現在是怎麼搭檔合作的問題，不是誰進誰退的問題」。
