前教育部長吳茂昆遭媒體報導，對中央研究院施壓並要求聘用其子吳孟真，有濫用特權的嫌疑。中研院今(18)日表示，報導內容與事實不符，吳茂昆未施壓，吳茂昆也並未要調任。

吳茂昆爭議多，不僅因「卡管事件」下台成了任期僅41天的「史上最短命教育部長」，還被人揭發擔任國立東華大學校長期間，在美國設立師沛恩生技公司，且將學校師生的發明成果移轉到該公司，並隱瞞校方用學校公款來支付申請專利所需的費用。遭司法院公務員懲戒委員會懲處記過一次。

而據《中國時報》報導，學界盛傳吳茂昆多年致力安插其子吳孟真在中研院物理所任職，指出吳茂昆將離開物理所，以利避嫌，並於2月1日轉調到中研院應用科學研究中心，以利吳孟真「卡位」。報導也提到，近期吳孟真在物理所網頁名列訪問學人，但來訪單位留白，引發濫用特權的質疑。

對此，中研院秘書長彭信坤今(18)日向媒體強調，這是不實報導，與事實不符，不僅沒有要將吳茂昆調職到應用科學研究中心的計畫，吳孟真在中研院更沒有任何職位，雖然吳孟真的確是物理所的研究學人，但他所擔任的訪問學人是不支薪的訪問研究，過去吳孟真與物理所便有相關合作，此次是趁他還在台灣時，參與物理所研究員陳啟東實驗室的討論，並提供意見，都按照相關規定辦理。撇清施壓一說，再強調中研院研究人員的聘任都按照相關規定與程序辦理，絕對沒有遭受施壓或安插人事等情事，更說希望媒體發揮自律及查證精神。

然而報導所質疑的另一點是，中研院物理所官網顯示，吳孟真頭銜為該所訪問學人，訪問期間自去年9月1日起至今年8月31日止，但與其他訪問學者不同，吳孟真的來訪單位則空白。對此，中研院物理所長張嘉升解釋，不支薪的訪問學者只要是其專業對研究有幫助，就可以擔任訪問學人，但如果是支薪的訪問學人，才會有比較嚴謹的聘用程序。