2018九合一選舉，民進黨大敗，從13縣市大幅縮減6縣市，繼黨主席蔡英文、行政院長賴清德請辭後，總統府秘書長陳菊稍早也宣布請辭。
陳菊表示，今夜的選舉結果很抱歉讓支持者失望了，她已經口頭向總統請辭總統府秘書長職務，深刻的檢討、反省，「感謝每一位願意給我們機會的人民」。
賴清德在晚間9時表示，他已向蔡英文口頭請辭，負起政治責任，不過，蔡英文在民進黨中央黨部的記者會中表示，在改革的關鍵期，政府的行政團隊必須保持穩定，因此，國家行政應維持運作，剛才賴清德雖然向她請辭，但「我請他繼續留下來」。
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