檢調查出有多達500位大學教授涉嫌以不實單據核銷國科會補助費。中央研究院長翁啟惠和台大校長李嗣涔和清大校長、國科會前副主委陳力俊等人，今(26)晚發表聯合聲明指出，全案只有少數教授有不實報銷、中飽私囊的情況，其餘教授都是因為太忙，委託助理幫忙報帳，所以應該檢討現行制度，而且「科研採購」和「公務採購」要分流。翁啟惠說，貪污「絕對不行」，但如果是為研究，應有更大彈性，不應該將公務體系運作用在教育和研究上。
翁啟惠舉美國為例，表示美國的研究人員有很大的空間能運用經費，因為美國看的是結果，翁啟惠指出，如果將公務體系運作用在教育和研究上，許多自美返台的學者會很不適應。翁啟惠等人並發表聲明指出，主要還是現行制度的問題，應該要檢討，他們也呼籲國科會組專案小組，將「科研採購」和「公務採購」進行分流，否則，照現行法令將這些教授定罪，恐怕將嚴重打擊學術界的士氣。
翁啟惠在接受中央社訪問時指出，科技研究的目的是要探討未知的世界，而科研變化迅速，無法在1、2年前就規劃好，應該比較彈性。翁啟惠坦言，他不敢相信有這麼多教授會公款私用，但如果是為了研究而有些改變，制度就有檢討的空間，給予更大彈性，對學術界才有正面效果。
