行政院長吳敦義今(31)日在臨時院會提出內閣總辭後，也說了一段相當長的感言，並細數任內多位閣員的成績表現。吳敦義說，行政團隊對於國家的貢獻，點滴在心頭，不論續留與否，將來還是有很多機會為國家做事。他也說，下禮拜就要移交，換冲哥當院長，不管組成如何，都要竭智盡忠，為國為民打拼，希望大家今後繼續幫冲哥的忙，讓行政院好上加好。
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吳敦義說，「我們還有很多總體目標要做，像優質文教、全面建設、和平兩岸、友善國際、廉能政府、活力經濟及永續環境，都是我們念茲在茲的，一日都不能鬆懈。」他到總統府後，也會全力支持鼓勵行政同仁，到全省走走，多讓民間力量支持政府，也會繼續請國會友人多支持行政部門。
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吳敦義並在總辭後的慰勉詞中，對於多個部會的政績特別加以強調，他說，據研考會所作的政府施政成果報告，充分說明行政團隊的良好績效，接任2年4個月以來，由行政院列管的總統政見414項，「已完成」190項，「執行中已具階段性成果」200項，合計390項，因此，要向這段日子以來共同努力打拼的工作夥伴辛勞及貢獻，致上最真誠的感謝與敬意。
吳敦義還特別提到，在H1N1襲擊最強烈期間，前副院長朱立倫擔任中央疫情防治中心的指揮官，前衛生署長楊志良及醫護同仁採取最正確的做法，讓疫情獲得控制。同時，在塑化劑風暴中，每個部會同心協力，把累積長達2、30年危害台灣社會的塑化劑掺入食品一舉掃蕩，重建MIT的響亮信用。
在財政工作上，吳敦義也力讚中央銀行總裁彭准南在全球金融風暴中穩定金融市場及秩序的努力和政績，讓台灣在全球震盪中保有復甦及穩定的基礎。
至於即將缷任的財政部長李述德，吳敦義也說，雖然坊間對減稅有不同的看法，但李述德在金融海嘯時期降低遺贈稅之舉，讓海外資金回流，讓台灣在金融海嘯衝擊中有復甦的動能。還有降低營所稅後，配合4年5千億的擴大公共建設，讓台灣從98年第4季開始，到99年有10.72%的經濟成長，讓98年8月6.13%的失業率降低到100年12月的4.18%，23萬多放無薪假的勞工也能回到工作崗位。最後，在網路使用上，吳敦義也稱讚國稅局開創性的做法如使用網路報稅、協助納稅人進行稅額試算等。
至於經濟部的政績，也受到吳敦義盛讚即使在金融海嘯襲擊時，每年進出口總值都創新高，證明過去2年多所採取的財政經濟各項措施都產生顯著效果，是成功的政策。
而在教育方面，吳敦義說，例如實施12年國教，是從57年以來，為中華民國提升教育跨出了43年來的一大步。還有齊一公私立高中學費、全面實施5歲幼兒免學費以及幼托整合等。另外，由於國防部及教育部的協調配合，被批評多年的軍教免稅也進行歷史性的改革。另教育部提出5年500億元邁向頂尖大學計畫、卓越教學人才培育方案，開放僑生及中國學生來台進修等。
最後，吳敦義也認為，有關農業、社福和外交方面也有相當不錯的政績，如稻穀收購價格調漲、8項社福津貼的調整和逾百國免簽等，都值得一提。
