行政院長吳敦義昨天在行政院會中宣布將於1月31日召開臨時院會，正式提出總辭，而由馬英九總統考量社會期待、人才遴聘與改革布局等因素，提名新任正、副院長。目前以現任行政院副院長陳冲的呼聲最高，副院長則以現任內政部長江宜樺最被看好，但因為江宜樺教職借調將期滿，江本人也傾向重返校園，為內閣新人事帶來變數，但由於新國會將於2月1日開議，屆時完整內閣人事案也將獲得確定。
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由於新國會將於2月1日開議，閣揆必須前往立院向新國會提出施政報告並備質詢，因此吳敦義在昨天的院會中表示，將於1月31日舉行臨時行政院會，提出內閣總辭案，而馬英九也可望在農曆春節期間，與府院黨高層密會內閣改組事宜，一旦確定將以新內閣人員赴立院備詢。
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根據慣例，祕書長及8部2會以外的首長、政務副首長及3級機關首長都會提前蓋好章，一併由人事行政局統籌處理，包括國科會轄下的北、中、南部科學管理局局長，還有衛生署轄下的健保局局長，總數90多人。在31日臨時院會當天，用印蓋章請辭人數不含吳敦義共17人，即副院長、6位政務委員及8部2會首長。
而配合行政院組織改造，行政院將增設一名專任發言人，政務委員的上限也由7席增至9席，而依照行政院新的組織法明訂，政務委員兼任首長的機關只有8個委員會，包括金管會、國發會、陸委會、海洋委員會、僑委會、客委員、退輔會等。因此，目前由政務委員曾志朗所兼任的文建會主委一職，將於5月20日文化部正式成立後，產生1位新任文化部長職務。
另由於金管會在7月1日新組織法上路後，不再是獨立機關，委員也不再是專任職，改由行政院聘任，為兼職形態，外傳金管會主委陳裕璋將轉進總統府任祕書長，但未獲府方證實。
