總統馬英九今(1)日在元旦祝詞中指出，下一個百年初始，在歐債危機的威脅下顛簸上路，他不願意粉飾太平，而選擇誠實面對人民，「民國101年將是關鍵的一年，我們必須加倍努力」，他希望效法40年前孫運璿、李國鼎等前賢打下厚實基礎，為下一代強化實力。同時，他也說，一個民主國家總統的挑戰，不僅是實踐自己的理想，更要豐富人民選項，將點燃下世代心中的蠟燭，讓他們發光發熱。
清晨6時許，在總統府前廣場，由響徹雲霄的太鼓揭開序幕，並以龍、虎、獅等吉祥物表演，慶祝101年到來。
總統馬英九伉儷、副總統蕭萬長伉儷約在6時30分左右圍著國旗圍巾從總統府內走到會場，馬英九身著立領飛行夾克，總統夫人周美青則以黑色羽絨衣與牛仔褲現身，受到民眾熱情歡迎，並紛紛揮舞手上國旗，現場旗海飄揚，場面壯觀。
接著由101名扮成空姐、太空人、農民等各行各業服裝的小朋友領唱，馬英九及民眾們大聲唱著國歌，一同見證國旗在總統府冉冉升起的時刻。
隨後，馬英九於總統府發表元旦祝詞時表示，百年交會這幾天，他心境非常清澈，站在歷史分水嶺上，過去百年歷史清晰在目，未來百年理路明確可尋，他想像百年後的國人也將檢驗這一代創造、引領、解決、留下了什麼，今天所做的一切都將決定未來歷史，他身為中華民國總統，深感責任重大。
馬英九說，百年後國人回顧這一代，會不會像國人今天想起前人林獻堂、蔣渭水、胡適、孫運璿、李國鼎一樣，發自內心說「台灣有你們，真好」？他並引用公益平台文化基金會董事長嚴長壽「教育應該不一樣」一書說，教育不是裝滿一壺水，是點亮每個孩子心中的蠟燭，讓他發光發亮，領導國家也是如此。
馬英九也強調，儘管外在環境嚴峻，但他仍對台灣人民有信心，對政府應變調整的能力有信心，對中華民國的經濟實力與文化深度有信心。
馬英九表示，40年前，在台灣經濟正值轉型之際，孫運璿與李國鼎為大家打下了厚實的基礎，「今天，在金融風暴後、世界經濟重整之時，我們當然也要該效法前賢，替下一代強化他們的實力」。
馬英九指出，過去100年，經歷了漫長的戰亂與動盪，在承平時期則努力追趕。在台灣人民的努力下，不論在科技研發、藝術文化、體育競賽、設計創新、人道援助等各方面，台灣的表現都令世界刮目相看；「我們的運動員、發明家、設計師、藝術家、科學家、國際志工、甚至於大學專科與高中高職的學生，在國際舞台上都拿出了亮麗成績」。
他說，不知不覺中，「我們已經從學習者蛻變成創新者；由風潮的跟隨者轉變為文化的領航者；由愛心的輸入者變成援助的輸出者；從拚命追求效率，走向靈活營運創新。這些轉變與成熟，值得國人歡喜驕傲，也是我們走向下個100年最好的憑藉」。
就在馬英九致詞後，主持人突然宣布一項「驚喜」，由馬英九與周美青前往群眾席與民眾握手，由於民眾太過熱情，還把周美青給拉痛了；其中，還有民眾在握手時，突然把帶來的小狗抱給周美青，希望周美青能摸摸牠，周美青被這個突如其來的舉動逗得笑開懷，也完成民眾心願。
另值得一提的是三軍樂儀隊的表演，他們手持重達6公斤步槍，秀出各軍種獨有槍法後，接著表演360度周波大拋槍、旋轉540度側拋槍、旋轉三圈1080度。今年還有「小小禮兵」4歲男童Ryan在下半場加入表演，與18名三軍儀隊隊員一同表演多種高難度槍法，包括旋轉3圈空中拋槍與雙手交叉轉槍等，獲得現場民眾熱烈喝采。儀隊還以陸、海、空成員排成「101」字樣，慶祝中華民國生日快樂。
