針對台南縣長蘇煥智指稱台北市歧視南部4個綠營執政的農業縣，「沒贊助，縣民就無法以5折優惠看花博」的說法，花博營運總部表示，所謂的「花博縣市活動週」即指該縣市能提供當週的藝文表演活動（一天一場或兩場均可），該縣市的居民即可在當週享有花博票價5折的優惠待遇，這是為了讓全台各縣市都能共襄盛舉，一起來參與這個屬於全台灣的國際性活動，並沒有藍綠之分。

至於原先沒參加「花博縣市活動週」的縣市，花博營運總部舉例說，還來得及參與，例如苗栗縣原本也是缺席的，最近才決定加入，所以，苗栗縣活動週就排在明年的1月3日至9日，而沒參加花博縣市活動週的南部4縣，如果也循同樣的遊戲規則，一樣可以優待該縣縣民購買花博票券。