正當中科三期后里地區居民再度北上抗議之際，行政院長吳敦義今(13)日接見前來向政府致謝的台灣科園工業園區同業公會理事長謝其嘉等一行，他們表示，感謝政府對科學園區廠商的輔導與協助，尤其是最近明快解決中科三、四期的環評爭議，形成一大諷刺。
謝其嘉等一行人表示，目前各園區廠商多能順利營運，訂單及產能快速成長，大部分廠商產能供不應求，今年上半年產值超過1兆元，各科學園區聘用員工數也已增加至目前的20餘萬人，今年底產值將超過2兆元以上，許多廠商已面臨缺工、缺料問題，盼政府能協助解決。
吳敦義表示，中科三期停工問題，台北高等行政法院7月30日裁定主文未要求訴外之善意第3人(廠商)停止營運，以友達為例，該廠建廠工人有4千人，供應廠商279家，若要在高等行政法院裁定外，擴大解釋要其停止建廠工程，則4千人立即無工可做，涉及的糾紛更難以估計。
吳敦義說，在尊重法院裁判的情形下，已先對公共工程停工，但為保障廠商之合法權益，環保署提引用大法官會議釋字第589號所揭示的憲法信賴保護原則，參照行政程序第117條、行政訴訟法等相關法律妥善處理並提起抗告，雖經最高行政法院9月2日裁定維持台北高等行政法院7月30日原裁定，亦即須俟新環評通過達成原裁定所附解除條件，並由國科會據以核發新開發許可，始能由中科局依法復工，唯因中科三期新環評結果已於8月31日獲得通過，國科會亦已核發新開發許可，完全適法。
