民進黨九合一選舉敗選後，行政院長賴清德去留引發關注，時代力量立委黃國昌表示，他對賴清德是否辭職沒意見，但他希望先將法務部長蔡清祥換掉。
黃國昌在臉書上表示，賴清德到底要辭職還是要留下來繼續奮鬥，他沒有什麼強烈意見，尊重賴揆與蔡總統的決定。
但黃國昌認為，前後兩任法務部長都是蔡英文欽點的人，現任的蔡清祥部長，搞不清楚狀況又愛說謊胡扯的地步，與前任邱太三相比，可謂是有過之而無不及。
黃國昌批評蔡清祥，自我感覺良好到敢在國會大言不慚地說「司法改革成效卓著」，他認為這讓人忍無可忍，「拜託，可以先把這位法務部長換掉嗎？」
