總統蔡英文即將卸任前，媒體傳出，針對因部分貪汙案被判刑確定，目前保外就醫中的前總統陳水扁，蔡英文已啟動特赦案，要在520交接前完成。對此，國民黨立法院黨團書記長洪孟楷強調，特赦是總統的權責，但要特赦之前要先向國人說明清楚，到底陳水扁的相關罪刑是不是已經承認？陳水扁的案件是不是該先做三審定讞？不是一紙特赦就能一筆蓋過。

洪孟楷指出，到目前為止，陳水扁有三審定讞的案件，被認定確實違法，另還有還在進行中的刑事案件，如果蔡英文要憑著一紙特赦，就將三審定讞及還在審理中的案子都一筆勾銷，國人沒有辦法了解真相，這是蔡英文不可迴避的責任。

洪孟楷質疑，過去8年，蔡英文都沒有特赦，在卸任前才要用權力特赦陳水扁，這是在賣人情嗎？但國人要的是真相和事實，讓陳水扁承認犯行，並且將進行中的案件都三審定讞，讓案情有清楚明白的交代，要特赦再來特赦。

國民黨立委羅智強也指，現在有幾個問題，第一、在特赦陳水扁之前，民進黨過去在執政期間，因貪汙對人民造成的傷害，要對人民有所交代。第二、這種踐踏保外就醫制度，甚至造成高雄監獄暴動，這對得起法治嗎？第三、蔡英文要不要先叫陳水扁回去面對剩下的官司？不然陳水扁又因其它案件被判刑，還要特赦第二波嗎？

羅智強認為， 特赦是總統的憲法職權，但他要提醒蔡英文，要特赦陳水扁哪一部分的罪？而陳水扁以身體健康因素為由，是無限期保外就醫狀態，從此相關訴訟都不再審判了，那現在這些訴訟是不是可以繼續進行了？蔡英文要特赦陳水扁已經被判刑定讞的部分，那訴訟中的部分還要不要特赦？這才是問題所在。