2024 總統大選落幕，最終結果由民進黨賴蕭配以約 4 成得票率當選，儘管國民黨重返國會多數黨，形成與 2000 年陳水扁執政「朝小野大」相似的局面，然而藍營仍須加上民眾黨 8 席才能穩當過半，藍白是否合作再次引起關注。而針對台獨立場鮮明的賴清德就任後，兩岸是否發生衝突的議題，前立委邱毅認為短期內不會，原因出於賴為「弱勢總統」，但前提是藍白必須合。
下屆國會政黨版圖顯著變化。本次大選總計 113 席區域／不分區立委方面，以國民黨 52 席，外加兩個友黨（無黨籍）立委重返國會最大黨，然因並未過半，未來議事表決仍須依靠本屆獲 8 席不分區的民眾黨協助，才可望有效和民進黨（51席）抗衡。
邱毅今（14）日於臉書上發文，指 2 月 1 日立法院開議第一件事，便是投票選出正副院長，而若藍白憑藉合作成功拿下，形成對賴清德的有效制衡力量，便能防著他「往危險方向傾斜」。
他呼籲選後藍白雙方的「鷹派人物」都必須自我克制。「尤其朱立倫底上幾個小將，可別為了急於表現，反誤了大局。」邱毅認為，國民黨主席朱立倫和立委韓國瑜最近該去拜會柯文哲了，立院正副院長選舉迫在眉睫，藍白合要不要合、怎麼合，都得看雙方的智慧表現。
他在貼文分析，大選前關鍵時刻，國民黨為了操作棄保，韓國瑜的「空氣槍論」，引發了民眾黨的不滿。不分區立委，柯的競選總幹事黃珊珊強硬態度，也觸動了國民黨的火氣。邱毅認為政治本是妥協的藝術，呼籲藍白合作才能有效制衡賴清德，防止賴讓「兩岸關係陷入無可挽救的局面」。
