進口雞蛋爭議連連，有業者將使用進口蛋為原料的液蛋產地標示為國產，後來又改標產地為雞蛋來源國，業者直指接獲畜產會通知才改標。農業部20日回應，中央畜產會6月誤以為製為液蛋後，因海關稅則號列不同就屬食品加工的實質轉型，才建議產地標為台灣，7月和衛福部確認後才知仍以原料產地為準，才通知業者，對畜產會對標示認知所生爭議、農業部督導不周致歉。

農業部專案進口雞蛋風波持續延燒，台中市金寶公司、新德貿公司接受畜產會委託代工生產冷凍殺菌液蛋，產品標示原產地台灣，疑涉標示不實，兩家廠商都強調，一開始都是依照中央畜產會建議來標示，之後7月又接到來文告知要以原料產地為準。有員工私下指稱「農業部的要求，我們敢拒絕嗎？」真的很倒楣，商譽也受到影響，不少客戶取消訂單。

對此，農業部發布新聞稿指出，畜產會6月間委託業者，將庫存專案進口雞蛋加工為冷凍殺菌液蛋，送回畜產會承租的倉儲轉庫存備用，畜產會當時對標示方式的解釋認知，原以為可依照「進口貨物原產地認定標準」第7條第1項第1款規定，原材料經加工或製造後所產生之貨物與原材料歸屬之海關進口稅則前6位碼號列相異者，可認定為實質轉型，因此使業者將產地標示為台灣。

農業部續指，實際上，依照「食安法」及衛福部於2019年11月7日發布訂定「液蛋衛生標準」及「液蛋產品標示規定」等相關法規，液蛋產品本即應標示 「原產地（國）」及有效日期，而畜產會於7月間另向衛福部確認始知應標示原產地才正確，畜產會獲知後，即通知業者此後應以原產地標示。

農業部坦言，對畜產會因其對標示方式認知誤解所生爭議，農業部有監督失周之處，向社會大眾表達歉意，也將督促畜產會後續應加強輔導業者正確標示。這些錯標產地的液蛋仍在有效期限內，全部儲存於畜產會倉儲，並未流入市場，畜產會將請加工業者更正目前庫存的產地標示。

此外，針對報導指稱雲林縣政府衛生局前往西螺鎮某間農產倉儲，發現有未過期的「冷凍殺菌液蛋」，產地來自台灣，並質疑農業部沒有提供完整資料。農業部深夜發布新聞稿表示，已於18日公布中央畜產會所有冷鏈倉儲地點，經查雲林縣政府19日前往的西螺倉儲為其中1間。

農業部說明，雲林縣政府在西螺倉儲看到的是中央畜產會的庫存液蛋，是中央畜產會請金寶蛋品加工後轉畜產會庫存，並非調度給洗選場或加工廠。日前提供各縣市的資料，就是日前公布的「中央畜產會調度給各縣市洗選場和加工廠的名單、數量與雞蛋來源國」，雲林縣政府轄內確實沒有畜產會調度進口雞蛋的洗選場和加工廠。