因暑假旺季將到來與近期疫情較之前平緩，預計將會有非常多旅客至小琉球遊玩，東琉線業者自6月27日起已陸續恢復正常航班，增班後東琉線每日增加近2,000人次運能、鹽琉線每日增加近300人次運能，業者也會視情況機動加班因應。

交通部航港局表示，航商業者調整航班需依照「航業法」規定報請航政機關備查，因先前受疫情影響，東琉線旅客量下降，各家業者紛紛縮減固定航班以為因應，但目前疫情已經稍微平緩，預期暑假期間，小琉球將吸引非常多的旅客前往遊玩，東琉線及鹽琉線的業者也開始調整航班因應，包括藍白航運公司原本每日5班恢復為每日7班，泰富航運公司原本每日4班也恢復為每日7班；至於鹽琉線部分，大福琉球航運公司原本每日4班增加為每日5班，業者也均依規定報航港局備查。

另外，航港局也強調，仍然不可以忽視疫情影響，將會持續關注東琉線及鹽琉線業者的防疫狀況，包括需要落實實名制、加強場站及客船開航前、後之清消作業等事項，並提醒旅客應確實佩帶口罩、遵守相關防疫措施。