繼5月梅雨季影響，６月上旬帶來的大量雨勢，造成更嚴重的農作物損害，經行政院農委會統計，農業產物估計損失高達8,824萬元，其中以南投縣損失3,454萬元，最為慘重。
農委會統計，目前各縣市受損情形，以南投縣損失3,454萬元最嚴重，占39%最多，其次是屏東縣損失2368萬元（占27%）、雲林縣損失1,925萬元( 占了22%)、嘉義縣損失463萬元(占5%)、苗栗縣損失188萬元(占2%)及臺南市損失176萬元(占2%)較為嚴重。
農產損失部分，農委會也指出，估計損失金額高達7,605萬元，農作物被害面積1,334公頃，損害程度佔了21％，換算無收穫面積274公頃；受損作物主要為百香果，被害面積154公頃，損害程度20％，換算無收穫面積31公頃，損失金額2,091萬元，其次為木瓜、番石榴、苦瓜及大豆等。
另外農委會也統計漁產損失，估計金額也高達1219萬元，受損漁產如雲林縣文蛤也因雨勢影響受損27公頃。
農委會統計各縣市受損情形，以南投縣損失最慘重。 圖：農委會／提供
農委會統計農產損失前五大部分。 圖：農委會／提供
