近日因為本土疫情升溫，台北市市長柯文哲提出若快篩陽性即認定為確診者，可不必再做PCR。北市聯合醫院醫師姜冠宇也支持這個看法，認為快篩2次若陽性準確率可達到95%，即可取代PCR。對此指揮中心指揮官陳時中表示，目前PCR量不足的狀況，若以快篩陽性取代PCR，會出現一成為非確診者，反而會造成後續更多問題。

柯文哲日前提出，未來快篩若陽性，就不用在做PCR確認，而被陳時中在記者會中否認，他認為國外通常是在疫情下坡後執行，台灣目前還不適合。而姜冠宇也提出同樣看法，他認為以「快篩取代PCR確診」，原因是若無症狀者2次快篩若都呈陽性，其準確率可達到95%，若2次快篩即陽性即被視為確診，民眾就不用特地跑醫院再做PCR檢測。

對此陳時中表示，目前PCR總量可達19萬，目前一天收到的不超過10萬，現在不是量的問題而是分配不均，因此他會要求地方再加開設採檢站，未來希望能與基層診所合作開立PCR採檢。他進一步表示，若以快篩陽性取代PCR，目前快篩與PCR相符程度為88.7%，因此中間會有一成為非確診者，而這一成非確診者則會有：匡列、居家隔離等等延伸問題，耗費的成本會更大，在法律上也會有限制人身自由之問題，對快篩取代PCR他不表贊成。