交通部於今年初因配合春節檢疫專案宣布自1月9日起桃園國際機場、松山機場、小港機場防疫車隊於春節專案期間嚴禁載送一般旅客，只能載返國檢疫民眾。而中央流行疫情指揮中心同意交通部自今年3月7日零時起，在持續落實相關防疫措施下，於載運入境旅客後，完成車輛清消通風30分鐘以上，則可載一般旅客。

春節檢疫專案至今年3月6日截止，指揮中心同意交通部自3月7日起，機場防疫車隊管理措施回歸交通部「居家檢疫者自機場返家交通方案」辦理，在維持原有的防疫措施條件下，持續落實加裝隔簾或隔板、駕駛穿戴手套、外科口罩以及隔離衣等防護裝備、至少要接種2劑疫苗、每週PCR篩檢監測健康狀況、無接觸化乘車單、旅客下車後立即清消、出車前量測體溫等相關管理措施。而駕駛於載運入境旅客之後，完成車輛清消通風靜置30分鐘以上，可載運一般旅客。

在實行檢疫專案期間，車隊駕駛配合之下，執行過程尚稱順利。交通部也將會持續要求機場防疫車隊落實各項防疫措施並加強車輛清消，以共同維護防疫安全。