被中國共產黨組織滲透校園，國立清華大學還沒搞清楚嚴重性？！媒體報導，清大校友會在未獲官方允許下，就在高科技重鎮的新竹清華大學、新竹科學園區，與中國廈門市政府、北京清華大學共設「清華海峽研究院」，為中國從事技術研發、攬才、投資等業務，辦公室就設在清大校園內涉及違反《兩岸人民關係條例》，今年1月還線上簽約，合作健康平台。
據報導，這個設立在清大校園的「清華海峽研究院新竹辦公室」，是由「清華海峽研究院」透過「自強工業科學基金會」，2016年開始向清大承租，地點在校內育成中心5樓，還成立「兩岸產業促進中心」，幫中國企業挖角台灣人才。
在該研究院官網上，今年（2021）1月28日，在廈門的清華海峽研究院與在台北的中華醫養健康總會，還就「兩岸健康創新賦能平台」正式簽署戰略合作協議，由該院的常務副院長郭樑、台北健康總會會長黃松雄、海峽院健康產業研究中心主任王政等，利用視訊簽約。
根據我國安單位掌握的資料顯示，清華海峽研究院具有中國共產黨官方背景，總部設於北京。在其官網介紹裡，該研究院於2015年4月，由廈門市人民政府、北京清華大學共同成立的按企業方式運作的事業單位；同時是北京清華大學繼深圳、北京、河北、浙江後，與地方共建的第5個地方研究院，強調要致力加快海峽西岸經濟區與「一帶一路」核心區建設，促進海峽兩岸融合，推動福建自貿區成為國際一流的科技創新、高技術產業化和人才培養基地。
據查，該新竹辦公室並未向教育部申請設立的紀錄，明顯是違法私設，民進黨立委賴瑞隆表示，中共透過校友會滲透校園，而國立大學公然讓中共單位進駐，應該以國安高度嚴辦，調查有無接受中共金援、指示，全力防堵科技機敏技術外流。
向我清華大學承租創新育成大樓的中國清華海峽研究院，大喇喇地進駐校園 ，卻沒有向教育部申請，明顯違法。 圖：翻攝自中國清華海峽研究院
