中央流行疫情指揮中心考量國內疫情仍有零星不明感染源本土病例，與相關單位溝通及評估後，因此自今年9月7日至9月20日維持疫情警戒標準為第二級，對此，蔡英文總統針對新一波疫情表示，指揮中心已全力防堵疫情，國際疫情相當嚴峻，國內防疫也不能鬆懈。蔡英文呼籲，請大家繼續團結防疫，只有確實做好防疫措施，才能保障自己和家人的健康安全。
對於長榮航空機師確診Delta與新北幼兒園8孩童染疫連環爆，蔡英文6日在臉書發文指出，目前國內還是有零星的不明感染源案例，尤其今天有9例本土案例，也引起大家的關注，指揮中心宣布將繼續維持二級警戒到20日，只在確保防疫的前提下適度放寬管制措施，讓防疫和民生需求可以兼顧。
蔡英文續指，指揮中心已積極採取因應措施，全力防堵疫情，且國際疫情相當嚴峻，國內防疫也不能鬆懈。蔡英文也提醒，國人還是要注意疫情資訊，也一定要互相提醒：落實勤洗手、戴口罩、實聯制並保持社交距離，只有確實做好防疫措施，才能保障自己和家人的健康安全。
新北市板橋區一間私立幼兒園爆發武漢肺炎群聚感染，幼兒園老師與丈夫確診後又發現8名幼童及1名家長確診；新北市長侯友宜6日晚間宣布，將提高至「強化二級警戒」，受波及的板橋區某附幼停課14天，某國小全校預防性停課3天；其他3校共5班、1個托育中心預防性停課；醫院及長照、安養機構禁止探視、醫院陪病僅限1人；集會人數縮減為室內50人，室外100人。
