台北市長柯文哲因中央無預警提前發放疫苗而埋怨自己遭到突襲，還暗批提前準備好的高雄市有內線交易。柯文哲7日又指，政務委員唐鳳推出新的預約系統沒事先找北市討論，而這波疫苗本來8日要發又提前到5日，數量從6萬變成12萬，突然告知「明天打」，只好緊急讓養老院先打，看到別縣市一周前就在分配，讓他直呼「太過分了！我們實在被整得很慘。」柯文哲也坦言對國產疫苗很悲觀，因為拿不到國際認證。他呼籲政府要認清國際局勢。
柯文哲7日晚間上「防疫國家隊」節目接受媒體人趙少康專訪，趙少康詢問他怎麼看唐鳳推出的新系統？柯文哲透露，唐鳳在禮拜天有跟他們視訊，當時他追問對方「你如果要上，為什麼不一早就上？」。結果唐鳳說他們有跟很多縣市討論，希望到65歲以下再來開放，柯文哲當場質問唐鳳「可是你從來沒跟我們討論？」，後來自己決定不為難唐鳳，因為「你是技術人員，不是搞政治的」。
柯文哲接著提到，這國家常常資訊不對等，疫苗發下來結果他不知道，或是發下來的量不確定，像這次要發新一波疫苗，原先說8日最後變成5日，6萬變成12萬，他知道台灣疫苗本來就沒有買到，都是人家送的，所以時間本來就不確定，但發下來還是應該明講，他自己猜其他縣市其實早就知道。柯文哲上月12日就曾批評，11日晚才得知疫苗要來，高雄一週前就發通知，這是「資訊不對等」。
柯文哲也在節目中重提當初遭突襲一事，強調那一次最慘，突然發下來然後告訴你「明天打」，最後北市只好讓養老院先打，不要完全都沒有動，不過看到人家一個禮拜前都在分配，他覺得「這太過分了」，自己也不想多講，講了又被說小心眼，但還是忍不住抱怨「我們實在被整得很慘」。對於台灣自行購買的疫苗到貨率不佳，柯文哲指出，現在疫苗是求過於供，他覺得等美國打得差不多了、疫苗供過於求，到時候「我就賭你那時候一定會賣我」。
柯文哲也透露，他對國產疫苗很悲觀，因為拿不到國際認證。去年十月他在醫學會內部會議表態反對做台灣自行開發疫苗，因為台灣不可能拿到美國FDA（的藥證），柯文哲分析：「很簡單，因為大國是要賺錢的，怎麼會讓你小國來做，小國疫苗再厲害都不會讓你拿到，這沒辦法，要認清國際局勢」。他說，連韓國都不敢開發疫苗，只有日本是採購、自行開發與代工都做，由此可看出日本是很謹慎的國家；他酸溜溜諷刺：「只有台灣最強，不買，也不代工，自己做」。
