武漢肺炎疫情持續發燒，美日捐贈的武漢肺炎疫苗相繼抵台，各縣市已於6月15日開打，近來卻頻傳長者施打疫苗後猝死，引起民眾恐慌，造成部分地區出現「緩打潮」。蔡英文總統對此表示，近來有些打過疫苗的老人家，有死亡及猝死的問題，指揮中心跟專家正在調查。她說：「每一個國人都是我們的家人，任何人離去，我們都會感到非常不捨。」
全台15日起開放日本捐贈近124萬劑AZ疫苗接種順序1至7類族群施打，其中以75歲以上長者（含65歲以上具原住民身分者）人數最多，20日進入施打疫苗第7天，全台傳出84人接種後猝死，但死因是否與接種疫苗直接相關，還有待釐清。然而，由於各地陸續傳出接種後死亡的案件，不少還未施打疫苗的長者持觀望態度，接種人數明顯減少許多。
蔡英文21日接受年代新聞專訪時回應，指揮中心根據科學分析判斷，目前接種疫苗的副作用都在可控制的範圍內，政府購買的疫苗，在各國施打經驗、品質也都相當好。至於施打風險，蔡英文強調，衛生單位都在全面監控中，她相信，相較於感染對健康可能造成的危害，接種疫苗還是利大於弊，請大家不要因為這樣而不去打疫苗。
蔡英文指出，只是接種之前要向醫護人員確認身體狀況，了解自己是否適合施打。有免疫問題的人可能要在醫師建議下施打不同類型疫苗，懷孕的婦女打疫苗也要有特別的考慮；藉由醫護人員協助，可以減少施打疫苗風險，指揮中心也會隨時注意施打反應，確保大家健康。
