武漢肺炎（Covid-19，2019新型冠狀病毒疾病）疫情延燒全球，在印度發現Delta變種病毒傳染力相當強，新北市長侯友宜呼籲，印度變種病毒來勢洶洶，呼籲中央要準備第三劑疫苗施打。台北市長柯文哲今（16日）表示，若病毒突變速度這麼快，不是疫苗打第三季問題，而是要打不同的疫苗問題，並坦言「這是很頭痛的題目」。
台北市政府下午召開疫情相關記者會，對於印度Delta變種病毒，柯文哲說，這是專業問題，武漢肺炎病毒突變速度滿快的，他以前一直覺得很奇怪，台灣人好像不太怕武漢肺炎，等到這次英國變種病毒進來後，也是一塌糊塗。
柯文哲指出，有時人種跟濾過性病毒之間有個對應關係，台灣人種一開始對武漢肺炎好像還滿有抵抗力，不太容易感染，臨床上看起來是這樣。但對英國變種病毒就不行，印度變種病毒好像殺傷力更大。不過，對台灣人來講是不是一樣或比較不怕，坦白講，真的要臨床遇到過，有些統計數字才知道。
柯文哲說，如果武漢肺炎病毒突變這麼快，不是疫苗要打第三劑問題，而是要打不同疫苗的問題。有人也說「武漢肺炎會不會流感化」，若演化速度夠快，隔一段時間已經變成一個滿新的品種，舊的疫苗若沒辦法對付，恐怕還要有新疫苗才有辦法對付，這是很頭痛的題目。
有媒體提問，機組人員防疫政策「3＋11」被視為疫情破口，指揮中心公布機組員若接種完兩劑疫苗後無須居家檢疫，只需7天自主管理，是否會覺得管制太鬆？柯文哲回應，這是很快台灣在國際社會要面臨的問題，因為疫苗護照很快會世界通用，有打過國際認證的疫苗、完整的兩次施打，且施打第二劑超過14天，理論上，入境無須居家隔離，最多是自主管理。
柯文哲認為，坦白講，打過兩劑疫苗最多是自主管理而已，這是按照科學做事。
