日本贈台124萬劑AZ疫苗，台北市首波收到7萬劑，其中1.2萬劑是中央寄放專案施打用，高雄則配發到9.1萬劑，外界質疑不平均。台北市長柯文哲更批評是「疫苗內線交易」，指揮中心回應，有依照各地施打對象人數進行配發。而先前不滿指揮中心稱「萬華是疫情破口」的無黨籍立委林昶佐認為，為了讓萬華以及整個台北都能守住，萬華應優先配給疫苗。

林昶佐提到，疫情爆發以來，他已多次跟陳時中部長溝通，討論北市的疫情發展，也與CDC持續討論疫苗配給優先順序的規劃，要求受創慘重的高風險熱區應更受重視。而13日指揮中心已在記者會上正式宣佈，日本疫苗第二批分配的原則，將「增加高風險熱區分配」，雙北將多獲得10％的疫苗。林昶佐感謝指揮中心體恤雙北疫情的嚴重性增加配給。

林昶佐呼籲柯文哲，應將為了熱區多配給的疫苗，優先給萬華，包括萬華75歲以上的長者、社福機構人員、照受照顧者與洗腎患者等其他萬華的公費接種對象。林昶佐同時也希望接著的疫苗分配都能依循指揮中心「增加高風險熱區分配」的原則。不只是因為萬華承受最早一波的疫情衝擊、承受各種外界污名的眼光，更是為了讓萬華以及整個台北都能守住，順利控制疫情。

柯文哲日前表示，歸根究底，想搶疫苗，都是出自人性，而林昶佐對此痛批：「足夠的疫苗，就沒有搶疫苗的問題了嗎？當然有。就如同糧食一樣，目前全球糧食生產過剩，卻還有搶糧食的問題；有些國家整體糧食也充足，卻仍有饑荒。原因很多，但政府因素很關鍵，例如被像柯文哲這種腐化無能卻又傲慢的政治人物或政府給搞爛了。」