武漢肺炎疫情嚴峻，儘管目前有疫苗陸續到貨，因數量不多，僅開放一至三類對象接種，但有消息傳出，北市某診所凌晨12點有大量民眾排隊等待施打疫苗，對此，前立委、林靜儀醫師在臉書連發數文，要求衛福部調查台北市疫苗流向。

林靜儀臉書貼文中表示「健保署編列了補助COVID-19疫苗接種處置費。合約院所必須「於接種之日起每日(或 24 小時內)將就醫資料上傳」依照「接種資料及疫苗消耗量通報」規範，傳送資料到「全國性預防接種資訊管理系統」，回報每日消耗結存資料。

隨後她又再另外一則發文指出，台北市衛生局的AZ疫苗是分配到醫院，由醫院為「造冊」的醫院醫護、診所醫護接種，為什麼昨天半夜疫苗會出現在診所？直接說，因為要拼接種速度，委託診所，也不會不行啊，為什麼不能承認？那就更讓人懷疑，是疫苗的分配、接種、結餘數量兜不攏的問題，還是接受接種的並非造冊登記的台北市第一到三類接種序位者。

林靜儀提醒，接種武漢肺炎疫苗的資料是要上傳到健保署的，這些都是正式的公務文書登載，如果造假，是有法律問題的。據她所知，民眾接種完拿到的疫苗卡片上是寫AZ，診所也在接種單位上面蓋了章。

針對民眾連夜排隊搶打疫苗，診所否認，並對《自由時報》記者指稱，現場排隊民眾是在做別的檢查。

她質疑，「三更半夜一堆人跑去打鏈球菌肺炎疫苗？ 你當我第一天出社會？」，基層醫療院所疫情期間病人少得不得了，你們病人會多到檢查做到半夜？ 解釋成「為了服務白天無法配合接種的醫護，晚上特別為他們加班」不是比較好聽？也會比較感人啊。為什麼不這樣解釋？是因為昨天有不是符合目前接種條件的人嗎？