有網友發現，在3月的「疫苗接種須知暨意願書」上早就註明BNT（輝瑞）疫苗已通過我國緊急授權使用，和指揮中心說的未通過緊急授權的情況有所出入，引發網友強烈質疑。對此，指揮官陳時中今（30）日也親自還原真相。
因為我國的「疫苗接種須知暨意願書」寫著「Pfizer-BioNTech之COVID-19疫苗是含有SARS-CoV-2病毒棘蛋白之mRNA 疫苗，本疫苗已通過WHO、歐盟、美國等先進國家及我國緊急授權使用（EUA）」，但台灣至今仍未買到BNT疫苗，當然也尚未通過EUA，兩者有所出入引起外界強烈質疑。
陳時中解釋，今年初COVAX平台的確有確認要提供台灣9.5萬劑BNT疫苗，而疫苗進入要施打階段一定會有緊急使用授權EUA，因此3月的疫苗接種意願書才會將BNT疫苗列入緊急使用授權。沒想到，對方卻在5月3日通知無法供應，才會有更新版本的意願書出現。
陳時中說明，前一波和BNT的合約有一點觸礁延遲，但我方仍沒有放棄希望，在1月底COVAX要配發BNT疫苗時，我方也表達願意接受，並在2月4日被告知可取得9.5萬劑BNT疫苗，會列入配送名單，進來後仍要通過審查程序，卻在5月3日被通知無法供應，非常遺憾。
另外，許多企業和民間團體爭相欲協助中央購買疫苗，但指揮中心始終沒有鬆口。對此，陳時中也表示，疫苗安全是主要考量，「其實我們歡迎大家來，但總是要講清楚引進的是什麼東西」，他指出，市面上疫苗很多，必須確認來源正確，來源若確定正確，後續行政程序繁複，指揮中心都會盡量協助。
