今國民黨立法委員陳以信於臉書上指出，秋冬防疫專案英文新聞稿內，針對國外核酸檢驗方法只列出其中一㮔RT-PCR，造成有國人無法回台的事宜，莊人祥稍早針對此事指出將會緊急修正新聞稿。而指揮中心於晚間回應，此事件為少部分外籍航空公司誤解秋冬專案之核酸檢驗報告項目所致，但避免誤解，已於網站上明列出台灣可接受國外檢驗報之相關名稱，以利各界參考。
指揮中心表示，秋冬防疫專案要求自機場入境或途經台灣機場轉機旅客，不論其身分或來台目的，均應向航空公司出示武漢肺炎核酸檢驗報告。本次因少部分外籍航空公司誤解秋冬專案之核酸檢驗報告日期、檢驗方式與檢驗結果等項目，而交通部民用航空局已與該外籍航空公司聯繫，並指出該公司因新制實施，部分人員對作業細節仍不熟悉，目前該航空總公司已重新布達相關單位，避免類似情形再發生。
指揮中心再次說明，新聞中所提「RT-PCR」為武漢肺炎核酸檢驗最常見的技術，亦為國際間普遍使用之武漢肺炎核酸檢驗名稱。而指揮中心於今年7月要求外籍人士入境需備核酸檢驗報告時，即於COVID-19網站專區英文網頁以 COVID-19 RT-PCR test作為該項檢測之英譯名稱。
另為避免各國實驗室檢驗技術或名稱差異所導致之誤解，另於疾管署外網中英文問答輯(FAQs)明列台灣可以接受國外檢驗報告註記之COVID-19核酸檢驗名稱包括「PCR、Real-Time PCR、RT-PCR、RT-qPCR （Quantitative Reverse Transcription PCR）、NAA（Nucleic acid Amplification）、NAAT（Nucleic acid Amplification Test）、NAT（Nucleic acid Test）、LAMP（Loop/Mediated isothermal Amplification）或Molecular Diagnostics等」，秋冬防疫專案亦依前述內容，於COVID-19網站專區完整呈現，供各界參考了解。
