今(2020)年將於9月27日舉辦的日月潭萬人泳渡至今已至38屆，主辦單位埔里四季早泳會會長蔡金雀表示，該活動南投衛生局曾因疫情關係考量決定不辦，後又在縣政府多次北上與衛福部部長陳時中開會後，再度決議日月潭泳渡可辦，南投衛生局表示，兩萬多名選手已確認與武漢肺炎無關，選手交通至下水前需經5-6道檢疫關卡，下水前和泳渡完成後均需配戴口套。 

晨泳會蔡金雀會長說，日月潭萬人泳渡活動今已至38屆，今年雖然遇到疫情卻決定續辦。但這個決策卻因為地方與政府之間意見相佐，讓原本準備活動的時間縮短成3個禮拜。蔡金雀說，事實上晨泳會曾於5月時建議南投縣政府停辦，但南投縣政府卻因為地方產業活絡因素說一定要辦，「但8月的時候南投衛生局又跳出來說不能辦，後來縣政府又到台北找陳時中溝通多次，才說要辦。」

蔡金雀說，目前該活動防疫措施，在南投衛生局指導下，務必做到「滴水不漏」的程度。首先是名單的過濾，南投縣政府衛生局表示所有選手名單都經過調查，只要是曾經有居家檢疫、或需做自主建康管理的選手都必需完成檢疫流程，名單內也未有任何匡列者。在選手交通的過程當中，只要上接駁車都必需測量體溫和戴口罩，現場志工也會隨時準備酒精消毒。

而選手下水前也必需戴口罩，經過體溫測量合格後會在手臂上蓋章，而下水前也有熱相儀和體溫測量器，體溫過高者會立即被請出，現場也有防疫人員會協助將體溫過高者送至會場隔離處。而選手上岸後主辦單位也備好乾爽口罩會分發給每個選手配戴。下水時也會將人數做分流，每次以200-250人為單位，盡量讓選手保持一定距離的情況下下水。

至於南投衛生局為什麼到了8月才考量不辦？是否因為商機過大，中央不願得罪地方政府？南投衛生局疾管科洪美吟科長表示，跟這個無關，完全是站在專業立場上來考量。她指出，8月時考量到因為暑假，疫情恐加溫，因此才會有停辦該活動的考量。隨後因台灣沒有新的本土病例產生，衛生局也去請教了相關專家，確認水上活動幾乎無傳染性後，才決定讓該活動可繼續舉辦。