港版國安法與第43條實施細則已施行，大陸委員會副主委兼發言人邱垂正今（9）天在例行記者會表示，我方嚴正警告北京與香港政府不要逾越、違反人權，侵犯我方在港相關團體與機構的界線，但我方駐港機構不會主動撤離，服務台港民眾努力到最後一分一秒。另針對前總統馬英九批評《港版國安法》與《國安五法》都是侵犯人權，邱垂正強調，兩者根本不能相提並論。

蔡英文總統曾表示，港版國安法若傷害到台灣，將有反制作為。邱垂正說，反制措施將視情況而定，對港政策也是會審酌香港與兩岸情勢、中共與港府作為，以及主要國家政策，後續也會檢討現行法規，評估進行必要應變措施。

此外，針對馬英九批評《港版國安法》與《國安五法》沒差別，都是侵犯人權。邱垂正則強調，《國安五法》與《反滲透法》都是透過民主立法程序，在必要範圍內強化民主防衛，是憲政體制的正常運作，防止境外勢力破壞。而《港版國安法》則未經民意授權機制，北京政府還繞過香港立法機構立法，兩者完全無法相提並論，中共相關作為都是遂行執政者政治目的工具，世人皆知。