武漢肺炎雖然有逐漸度過高峰期的趨勢，但各國疫情依然嚴峻。日本航空宣布，6月將取消大量台日航班，只剩下桃園-成田、高雄-成田有班機。

根據日本航空公布資訊，6月份桃園-成田僅剩JL809 /JL802，原60架次，減班24架次，於週一、週二、週四、週六飛航；高雄-成田來回航班JL811 /JL812原60架次，減班52架次，於周六執飛。

至於桃園-關西JL815 /JL814持續暫停，預計7月1日JL814會從桃園出發，不過仍須看疫情決定。