為因應敦睦艦隊可能存在的武漢肺炎（COVID-19）社區傳播風險，不少地方首長近日均表示若疫情漸趨嚴重，將不排除採行封城手段，北市長柯文哲也宣布將進行桌上推演。對此，中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中回應，敦睦艦隊的社區防線當然要守好，但台灣現況與封城仍有段距離，至於超前部署、預演則是有必要的，將儘速把防社區傳染3階段方案送給地方政府想定。

針對地方政府表態要封城，陳時中回應，地方政府基於保護地方居民，有他的關心跟一定的作為，但還是要有一定的科學基礎在，敦睦艦隊的案子（指揮中心）當然很關心，希望將社區的防線守好，但台灣現在的背景是已經10天未見本土個案，針對可能接觸者防禦是有必要的，但台灣現況跟封城距離是有點遠。

陳時中補充，但超前部署、預演跟地方的想定是有必要的，日前指揮中心提出的防社區感染3階段方案，也會在匯集各部會主管單位意見後，儘速交給地方政府想定，地方政府有任何狀況都可以跟中央討論。