台鐵、高鐵陸續在車站安裝紅外線體溫感測器，目前若乘客體溫超過37.5只能柔性勸導返家休息或就醫，不過，從4月1日開始，搭乘前述交通工具的乘客如體溫超過規定，得以拒載。
台鐵、高鐵目前規定是體溫超過37.5度者只能柔性勸導，但經交通部與流行疫情指揮中心研商後，從4月1日開始，不但進入交通場站要開始量體溫，體溫超過規定者得以拒載。交通部要求各主要交通場站，包括鐵公路車站、機場、高速公路服務區、郵局營業處所自4月1日起量測體溫，5月1日起全面實施。
交通部表示，連續量測2次額溫均達37.5°C，或第二次量測耳溫達38°C者，將勸導其返家休息及就醫，並依傳染病防治法第37條第1項第5款及第3項規定，不得搭乘大眾運輸，或進入服務區、營業處所等人潮聚集空間。
清明節是交通高峰期，交通部面臨挑戰，在陸運及觀光方面加強防疫，包括各車站消毒頻率由現行每4小時一次提升為每2小時一次，台北、桃園、台中、台南及左營站等5個高鐵主要車站，以及台鐵基隆等22個大型車站將在清明連假前完成紅外線體溫測溫儀的裝設。台鐵完成84名防疫天使的招募，將協助旅客體溫量測作業，高速公路各服務區服務大廳也將自4月1日起全面量測體溫。
另外，為了避免群聚感染，台鐵於清明連假期間暫不提供長途列車站票，高鐵於假期期間實施全車對號座。
此外，機場防疫車隊已與各服務區建立通報機制，如有進入服務區如廁需求，各服務區將派員引導至指定停車區域，離開後隨即進行消毒作業。觀光部分，也將於各遊樂園區入口及相關服務空間量測旅客額溫，封閉活動空間則暫時關停用，或請遊客配戴口罩並配合人數管控始得進入。
在海空運方面，除各海運國內客運航線已全面實施乘客體溫量測外，並將依航班密集程度加強清潔消毒，空運部分，全國各機場將自4月1日起實施國內、國際航線均於旅客進入安檢線前量測體溫，桃園機場部分並將於第一、二航廈入口處即以紅外線測溫儀量測進入航廈人員之體溫，如有體溫過高情形，將透過衛生單位協處，並拒絕旅客登機。
