武漢肺炎爆發，台灣與中國協商使用包機將滯留武漢台灣人載運回台。第一次武漢包機由東方航空執飛，載運247人在2月3日抵達台灣，其中一名台商經檢測為確診案例。從第一次包機至今經過一個多月的協商，終於啟動第二次包機，這次由華航、東方航空共同載運。負責第一班的華航飛機已於中午起飛，預計今晚飛返桃園機場，第二班包機由東方航空載運，預計明天凌晨抵達台灣，總共載回470人。
2月3日第一批武漢包機返台後，經過一個多月協調，終於啟動二批包機。本次將由華航、中國東方航空執飛，預計於今晚8時30分及明天凌晨0時30分降落桃園機場，每架飛機各載235人，包含台灣向中國提出的優先返台名單，共470人回台。
陳時中表示，華航的飛機上有4位醫師和9位護理人員，包含一位領隊、一位檢疫醫師、一位小兒科醫師、一位婦產科醫師，以防有老幼婦孺或孕婦的醫療需求，機上也備有藥物與急救箱。
陳時中說，乘客會穿搭全身防護隔離衣、口罩、面罩，並採取間隔坐法，不會像一般飛機那樣坐得那麼密集，機上會預留空間給有緊急狀況的乘客使用。下機之後，乘客會分區來坐，依照SOP進行檢疫，有特別狀況的話會直接送醫院，沒有的話就送往檢疫所進行採檢。這次依然設有安全組、後勤組、衛生組，會分送至3個檢疫所，下機後約需3小時作業時間。
經過先前的經驗，陳時中也提及，會先弄清楚返台者之間的親屬關係，以方便安排檢疫所居住房間，免得大家回來還要等待重新安排住處，避免大家心情浮躁。一切順利的話，整備時間會大幅縮短。
陳時中指出，現在台灣檢疫所的數量、設備跟採檢量能跟上次武漢包機比起來已經大幅提升，當時檢疫所大概只有6、700個，為現在的一半，設備、隔離情況也不是很理想，經過整備之後，現在後勤資源已經達到理想地步，採檢量能也從每天300多個提昇到每天可採檢3000個。因為採檢量能提高、檢疫所設備好、可接納量變大，才能接回400多人。
陳時中說，會在能力範圍內盡量幫助國人，但是基地一定要守好，以免沒救到人反而害到自己。雖然有很多媒體欲追問更多包機細節，包括東方航空檢疫細節、未來會不會再持續包機接回海外台人等等，但陳時中說，這是最後一哩路， 講太多會產生誤解，請大家耐心等待明天報告。
