新冠肺炎席捲全球，多個國家自1月起限制旅客出入境，以及航空公司陸續宣佈取消航班。2019年12月登錄興櫃、單月營收7億元以上的台灣虎航2月營收5.84億元，相較1月營收9.03億元，大減35%。

台灣虎航解釋，今年1月適逢學生寒假、農曆過年等，出國人數較多，去年過年是在2月，因此比較基礎不同，但可見累計1至2月營收14.88億元，年減超過13.1%，再加上受疫情打擊，民眾出國意願降低，預估3月營收會再下降。

隨著疫情持續升級，菲律賓及澳門陸續升級入境限制，台灣虎航澳門航線自2月4日至3月31日共取消322往來班次（約佔台灣虎航全年班次約3.4%）、菲律賓自2月11日至3月31日共取消61往來班次（約佔台灣虎航全年班次約0.7%）。

另外，台灣虎航韓國航線自2月25日至4月1日共取消72往來班次（約佔台灣虎航全年班次約0.8%）。