澳洲近期關切中國孔子學院的影響力。對此，澳洲中國專家麥葛瑞格（Richard McGregor）質疑澳洲為何不能自己資助大學開設中文學習與文化的活動?他認為，「我們是富裕的國家，大學有很多錢，為什麼我們需要把教中文外包給實際上是中國政府的機構？學中文、培養中文能力很重要，但為什麼我們需要中國的資金？」
澳洲廣播公司昨(10)日報導，過去幾年澳洲的大學發生一系列的爭議事件。開設於新南威爾斯州中、小學的中文和中國文化課程因洗腦式教學引發風波，受到州政府審查，澳洲的安全情報機構也開始與各大學建立關係，提醒他們注意與中國合作可能對學術自由、敏感研究和知識產權帶來威脅。
該報導指出，歐洲漢學學會2014年在葡萄牙布拉加（Braga）舉行研討會，台灣的蔣經國基金會是其中的贊助單位而列名會議手冊，相關資料卻被中國孔子學院負責人撕下，主辦單位以公開信譴責，但這起事件沒有引起太大關注，澳洲幾乎沒有報導。
近年來孔子學院在美國等地已受到嚴格檢視，中國與各國的中、小學校合作，全球共有548間孔子學院（Confucius Institutes）、568個孔子教室（Confucius classrooms），澳洲有14所大學有孔子學院，67個孔子教室。澳洲戰略安全專家貝比吉（Ross Babbage）表示，澳洲學術界大大低估了孔子學院帶來的風險。他說，任何想要公開討論人權、西藏和台灣議題的人，都會被反對者阻止發言，而這些人都是與孔子學院相關的人。他認為，孔子學院利用語言教學和文化訓練的名義作為保護，在包括澳洲等很多國家從事很多其他活動，例如間諜活動，且規模很大。
然而，墨爾本的拉特普大學（La TrobeUniversity）指出，學校的孔子學院自從設立後並未審查或干預學術活動，雪梨大學（University of Sydney）也表示，孔子學院純粹是促進中文與中國文化，沒聽說有學術審查。
