目前許多地方都面臨到缺蛋危機，且部分區域還買不到蛋，而也有輿論指出是與種雞的疫苗出包有關，農委會昨（21）日晚間開記者會表示，與疫苗無關，主要是因為氣候變化與水災，但養雞協會蛋雞組組長黃榮珍表示，疫苗打了無效。
缺蛋風波從年前開始延燒，一路漲價到20年的新高點，而農委會表示，過去是因為823水災造成雞隻死亡，而且過年期間有老母雞在汰換，因此才會造成蛋量的缺口，而先前也爆出芬普尼毒蛋事件，蛋的問題層出不窮。
養雞協會蛋雞組組長黃榮珍表示，造成種雞死亡的原因還不確定，但在疫苗方面，在協調會議中，除了有人提出「打了沒有效力」以外，也有意見表示根本是拿錯疫苗。而農委會防檢局組長徐榮彬也說，馬力克的疫苗十分特別，需要放在液態氮中保存，且一開封就一定要施打完畢，若是操作不正確恐怕就會有所影響。
而徐榮彬也表示，先前外界提到因為馬力克疫情而造成200萬隻雞隻死亡，他表示，馬力克的疫情是有增加，但不到大幅增加，且200萬隻的數字沒有根據，因此對此存疑。農委會也表示，調查之後發現馬立克疫苗宣稱有問題是在2017年10月後，迄雞隻能產蛋可能造成缺蛋的時期應是2018年3到4月間，但缺蛋是在2018年8月後。
為了防範疫情，防檢局也加強檢測場數，其中蛋雞場年度監測場數提高為2倍達360場，約占全國蛋雞場之20%，而108年迄今蛋雞場禽流感案例數為4例，也並未接獲動物防疫機關通報雞隻罹患馬立克病。但由於馬立克病毒屬於乙類疫病，雖然需要通報，但沒有規定時效。
而知情人士指出，有許多農民不希望通報疫情，擔心被防疫單位發現需要全面撲殺，而找了教授學者出面處理，但還是沒有改善，而學者也並未負起通報責任，因此加重疫情。
