國防部基於國家安全，委由中科院研發「國軍智慧型手機自動化管理系統（手機MDM）」，打開APP後，只要進入軍事管理區域，便會自動鎖住攝影、熱點分享、定位及藍牙傳輸功能，但這項APP近期被Google Play認定為惡意程式，建議國軍卸載。對此，中科院將對Google Play發出非惡意程式聲明。
MDM程式可從Android與iOS系統的網路商店下載，但近日使用Android系統的國軍陸續接到Google Play安全防護系統通知，指其可能為惡意程式，建議用戶停止使用並且卸載。
中科院回應，MDM可以透過Internet下載安裝App，可能下載安裝的數量較多，經由Google大數據分析，因此判讀其為可疑程式，目前已通知國防部MDM功能正常，非有害的程式，不需要移除，即可正常使用。中科院也隨即更新程式系統，目前初步測試正常，後續將透過國防部發布各個軍種使用。
中科院強調，針對「其應用程式的驗證工具，錯誤封鎖以及向使用者發出警告」一事，將對Google Play提出MDM非惡意程式聲明。
MDM是管理國軍使用智慧型手機的主要方法，此程式可成功在Android系統中使用，卻無法攻破iOS系統，使用者可以隨時刪除，在保護國家安全的考量下，去年7月禁止iphone入營，此外，目前被禁止智慧型手機還有，華為、中興、小米等中國廠牌手機。
不過，iphone的封閉式系統也別有用處，據悉，我國不少軍文機敏單位，都認為蘋果iPhone手機使用的iOS封閉式作業系統，不易被滲透或植入惡意程式，安全性較高，均要求高層官員須使用iPhone手機聯繫公務。
