行政院長賴清德今（25）日在院會中針對「台鐵普悠瑪1021事故」報告進行5項裁示，其中包括由張景森政委主導成立「運輸安全委員會」，獨立調查陸、海、空重大事故，建置更完全、完善的運輸環境，請交通部及人事總處儘速研提相關組織法及作用法草案，並於一個月內送立法院審議。
賴清德強調，台鐵普悠瑪1021事故造成多人傷亡，國人同感憂傷，社會也惶恐不安，行政院再次向罹難者表達哀悼， 祝福傷者早日康復，並向社會大眾道歉，同時也感謝中央、地方及民間協力參與救災、醫療、後事處理各項工作的每一個人。「前事不忘後事之師」，政府應該痛下決心，全面檢討，避免遺憾再度發生。
賴清德並提出五點裁示，包括：一、為獲得社會信任，行政院特別成立院級的行政調查小組，由政務委員吳澤成擔任召集人，後續的調查務必公正、客觀、公開透明，絕不徇私、不護短，讓證據說話，以昭公信，也才能夠解決爭端，得到社會信任，踏出改革的第一步。
二、交通部應進行普悠瑪的全面安全體檢，在未完成前尊重專家的意見，並在新馬車站彎道減速慢行，以策安全。後續普悠瑪的體檢，也務必踏實，確實執行。
三、台鐵要痛定思痛，進行大體檢，解決多年陳痾，除了從人、車、路以外， 包括管理及各個層面，都應全面檢討，此部分請張景森督導，希望未來台鐵能夠因為這個事件，更加安全、更加有效率，而且能提供更好的服務，如此才能告慰亡者在天之靈。
四、行政院決定成立「運輸安全委員會」，獨立調查陸、海、空重大事故，建置更完全、完善的運輸環境，請交通部及人事總處，儘速研提相關組織法及作用法草案，於一個月內送立法院審議。
五、後續包括醫療復健，請衛福部持續協助各大醫院，針對住院病人，特別是加護病房病人，應該提供最好的醫療。特別要注意復健的部分，羅東聖母醫院有2位脊髓損傷病人，一個是頸椎，一個是胸椎，下半身恐癱瘓，後續若出院後，其復健及居家生活環境改善，甚至生活的照顧，交通部都要負起責任。
賴清德特別提到，其中有一位姚女士頸椎骨折，兩個孩子都還在唸書，她的先生已經過世，單親撫養兩個小孩，後續的生活照顧，不論是對於罹難者或重傷者家裡的生活照顧，均要提供確實幫助，而非僅給予死者或重傷者金錢，政府就沒事了。我們要避免因為該事件影響其未來的生活及孩子未來的前途，請陳美伶政委及交通部持續與台東縣政府等共同合作，讓後事辦理能更加順利。
賴清德最後強調，台鐵在歷史上發生很多次意外，但是，進行檢討常流於表面或是抱殘守缺，這次要痛下決心，要進行全面性的檢討改革，如此才有辦法向社會大眾交代，也才有辦法告慰亡者在天之靈。
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