行政院3日召開520交接事宜的第2次會議，行政院副院長杜紫軍會後指出，包含行政院本部與各部會等29份520交接作業摘要及2016年度的法定預算書、摘要報告包含業務說明、組織架構及人員編制、預算編列與執行情形、已完成、推動中、將規劃的重大政策的資訊，都將在4日上午10時前送到民進黨中央黨部。
杜紫軍邀集各部會召開520交接會議，他下午說明，這次請各部會確認共29份資料，還有些細節要微調，4日上午10點前會把首批資料都送到民進黨部，也和交接窗口約好，他們會派人簽收。而這些資料包含部會業務範圍、人員組織、預算執行狀況及過去執行業務的結果，現在執行的重要政策等。
同時，政院本部資料也包含摘要報告一份，內容為立法院通過法定政府預算書的完整資料，簡報包含組織架構、人員、預算編列情況，近8年業務完成的政策，現在、未來推動的政策等，詳細版還會包含更機敏的資料，但需待對方安排好交接窗口後，再由部會進行簡報並交接。
杜紫軍說，民進黨已就關心的議題要政院提出進一步資料，包含防汛、防疫、組織再造、年金改革、用電規劃等，他們有給議題清冊，會請部會準備後再由政院提交。而且除了提供資料，政院也會安排業務說明跟座談，由民進黨指定時間、地點、主持人及專家，政院再指派適當人員說明，這個模式雙方已討論且有一定共識。
不過，在雙方還未正式談妥29個單位的窗口之前，基於國家機密保護法，政院暫時無法提供機敏資料，但仍會儘量提供書面資料。杜紫軍解釋，29個單位其實業務繁簡不一，所以不一定要同時把29個窗口都提出，民進黨可以先提重要部會的窗口，若某部會先確定，就能先談。
至於民進黨日前曾對教育部推動的5年千億高教藍圖計畫表達不滿，杜紫軍強調，這可能是溝通上的問題，高教藍圖計畫真正定案是在6月，7月才送立院，現在要做準備工作，以免來不及，決定權仍會等民進黨接任後再決定。而例如科技預算部份，也是因為要預先編2017年的預算，先訂出大方向，請各部會提計畫，否則會來不及，這是溝通說明上的問題，民進黨得到的訊息未必是正確的，「若他們有問題，直接來找我們」，以避免誤解造成困難。但他也說，目前跟民進黨溝通算是滿順暢的，作法上也已有共識。
