原訂27日下午5時閉幕的全國能源會議，因與會者對於核電相關議題意見分歧，會議到晚間11時才舉行閉幕，行政院長毛治國表示，對於核電等價值不一無法凝聚共識的議題，將架設網路平台，讓大家持續進行討論，希望藉此凝聚社會共識。對於會議結論共識，行政部門也會著手落實。
全國能源會議歷經近14小時，議程大延宕，整天的討論中，與會者對於核電相關議題意見分歧，與會者還數度因立場對立爆發口角，鹽寮反核自救會總幹事楊木火質疑能源會議的背景資訊不正確，還一度衝到主席台前下跪要求大會更正，逼的主持會議的經濟部長鄧振中等人急忙攙扶。
會議晚間11時結束，由鄧振中等人總結報告，毛治國上台致詞時，也特別向與會代表一鞠躬，表達感謝。毛治國指出，儘管為期2天會議引發熱烈討論，但共識仍待建立，其中最重大的仍是對於核能風險以及核廢料處理看法分歧，另有少部分涉及客觀事實認知，還必須進一步確認、釐清。
他相信，針對不同的能源組合，唯有客觀而完整地認清利弊得失，並透過充分的討論，才能作出真正負責任的選擇。
此次大會共有158項共同意見，201項其他意見，對於各界關心的核電廠是否延役，核四是否啟封等議題並無共識。毛治國表示，短期內可實行的共同意見部分，行政部門會儘速著手規劃推動，長期部分，也會研議循序漸進的推動方式，至於還未有共識的議題，將以「開放資料」的方式，架設網路平台讓各界持續討論。
