中央補助高雄市相關建設42案經費5億3000萬元，9月以後陸續核定，高雄市議會以市府未按開議前15天送達議會，而未交付審查，高雄市長陳菊擔心補助墊付款年底若未執行，恐被中央收回，希望議會能審查。

高市議會第一屆定期大會8月底開會，今(29)日閉幕，針對補助墊付款未付委，議長許崑源表示，市府逾期不送，也未向議會說明；陳菊則指市府秘書長和財主首長多次拜訪議會並說明。陳菊認為，選舉到了，政黨難免有競爭，是民主常態，不過她仍盼議會能審查市府墊付款，以免被中央收回而影響建設期程。

許崑源指出，依照議事規則要送審預算或墊付款應在議會定期大會前15天送進議會，這些墊付案都未依規定送來。他說，如果有急迫性，是可以用議長交付案處理，但沒看到市長到議會溝通。如果市府認為墊付款很重要，就應由市長出面說明，他籲市府不要搞民粹。

市府財政局長簡振澄說，由於中央補助款都在9、10月間核定，確實來不及在議會8月22日開議前送達，但市府有透過秘書長與議會秘書長協調，並非全無溝通。陳菊強調，為免墊付款被中央收回，將透過立委與中央溝通，設法保留。

中央補助項目包括水利署流域綜合計畫、楠梓區污水下水道系統工程、原住民地區土地及自然資源保育計畫、老人健保及部分社福補助等。民進黨議員候選人李柏毅、羅鼎城、高閔琳、何權峰質疑議會說永遠要和人民站在一起，但卻拿議事程序問題來杯葛審查，根本是刁難市府，但受害的卻是一般民眾。