監察委員尹祚芊在8月14日提案彈劾台大醫師柯文哲。對監委指控柯文哲對於器官移植協調師訓練不足，柯文哲今（27）日第3度為文反問監委，衛生署、登錄中心之版本為何？其實是根本沒有。他是今年又被徵召開始建立這個制度，「事情叫我做，做完再把我當戰犯處理」。
柯文哲24日在新頭殼部落格為文，一一反駁尹祚芊提出的彈劾理由。今天發表第3篇「資料得出相反結論 監委喪失公信力」文章。在文中，他先列出監委的指控：（台大醫院）未有一套完整之見習訓練計畫及課程，亦未要求技術考核，在協調師未曾接受完整之職前及在職訓練與對其專業能力進行有效考核下，被彈劾人即由其獨力執行移植手術之前置作業。
對此，柯文哲回應，台大OPO（器官移植）白皮書對於協調師之職前訓練計畫皆有明文規定，且分門別類條列該學習之項目，並指定負責人。如果認為台大醫院作得不好，請尹監委明白公布官方的版本為何？或者她認為應該的版本？然後用同樣的標準去檢視所有當時其他的OPO醫院。
柯文哲表示，今年器官捐贈移植登錄中心才開始開辦協調師認證課程，只要上課2天參加筆試通過，就可獲得器官捐贈協調人員證書。請問這才是尹監委認可的「完整的見習訓練計劃及課程」？
他說，這2天12堂課中，他負責上3堂課，他是整個訓練課程規劃的起草人，上課教材是他寫的，考試題目他出一部分，最後全部也是他審核的。是否日後有任何器捐協調師出事，尹監委又要彈劾他訓練不力、努力不夠？敬請明示，以便日後替公家機關做事的人有所借鏡，早知進退取捨。他並提醒監委，「不要忘記這原本是政府以前就該做的事」。
對於監委尹祚芊接受媒體訪問時，不願意回應柯文哲的反擊，柯文哲表示，這是尹監委發現自己東拼西湊的資料禁不起考驗，就想逃之夭夭。他說，「你今天捅出這個摟子，也應該自己出面收拾殘局」，怎可一句「沒有回應」就想應付過去，那不更顯得心虛嗎？
