針對總統馬英九在今（20）日就職演說中再度提及「一國兩區」講法，前總統李登輝透過臉書批評，兩岸人民條例是國內法，在處理兩岸人民事務，不涉及國家定位，以此去推論兩岸是「一國兩區」的政治定位，這根本就是扭曲歷史，不負責的行為。
馬英九在今天就職演說中指出，中華民國憲法是政府處理兩岸關係的最高指導原則；「一中」就是中華民國。依據憲法，中華民國領土主權涵蓋台灣與大陸，目前政府的統治權僅及於台澎金馬。換言之，20年來兩岸的憲法定位就是「一個中華民國，兩個地區」。
對此，李登輝透過臉書表示，馬總統再提出「九二共識」、「一國兩區」的主張，說這個主張是從他開始，領導者不識歷史，扭曲歷史，不知要將台灣帶往何處，令人擔憂。他希望，大家能瞭解台灣主權發展的歷史，不要被政府矇騙。
李登輝表示，我國歷經終止動勘、兩岸對等談判、國會全面改選、總統全民直選的歷史演進，台灣已發展成為一個主權在民，民主、自由、主權獨立的國家，我國主權屬於台灣兩千三百萬同胞，領土為台澎金馬。
他說，他在1999年「德國之聲」專訪及1999年10月27日美國「外交季刊」的文章，都以總統身分向國際宣示，兩岸是「特殊的國與國關係」，我國不包括中國，不會有兩區的概念。
李登輝指出，中國從不接受「一中各表」，在此之下馬總統先承認一中，自我矮化，已嚴重造成台灣主權的流失，更違反主權在民的原則，根本就是民主反動、威權復辟的主張。
